细胞计数快准狠，还得靠ImageJ这两把刷子！

Cracker

作者：子非鱼
遥想当年，初遇细胞实验时，最让小编头疼的就是给细胞计数了。虽然计数板这个傻瓜式检测方法比较简单粗暴，但总会让人晕头转向、数到眼瞎，而且万一一个不小心被其他人打断了思路，分分钟前功尽弃，真是恨不得以头抢地尔。

然而各位小伙伴之所以觉得数细胞如此辛苦，是因为大家还没有掌握细胞计数的正确操作。此时，ImageJ这个大家耳熟能详的图像操作软件，携带着两大法宝，可快速将大家从数细胞这个大坑中解救出来。
法宝一：多点工具法
1. ImageJ打开一张需要计数的图片。


2.激活多点工具。其位置在点工具菜单里 ，右击点菜单，选择多点工具 。





3.直接在图中点击目标即可，软件会自动在点旁边出现数字代表数量。



4: 双击点工具菜单，可以修饰点的形状（Type）、颜色（Color）、大小（Size）。但记住勾选 Label points。



5: 若点选错误，可以按住Alt，然后单击点，就会去除点，并且重新计数。


法宝二：阈值分割法
1. 将图像拖动到Image J工具箱中，点击Image > Type > 8-bit ，将图片变为黑白图，细胞为白色，背景为黑色。


2. 反转图片，Edit>Invert，使得细胞为黑色，背景为白色。随后调整阈值， Image>Adjust>Threshold，通过阈值窗口中的滑块调节合适的阈值，将目标包含在阈值内。调节合适后，点击阈值窗口中的应用Apply，则调节好的区域就变成黑色区域。


3.Analyze>Analyze Particles。弹出窗口，Size表示设定以像素为单位的区域大小是我们想要计数的。勾选Display results（显示结果），Clear results，Summarize（总数）即可。也可以在Show下拉菜单选择Outlines，展示区域轮廓。


4.点击OK，弹出结果窗口，从中我们可以看到细胞总计数，也可以看到目标区域的整体面积，以及每个目标区的面积。


参考文献：Quick and Easy Automatic Cell Counting
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janewang

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lfc85

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